15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03550 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF03550  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  100 
 
 		 612 aa  1253    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199341  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10918  sorting nexin Mvp1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17180)  32 
 
 		 738 aa  172  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547553 
 
 
-
 
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  41.89 
 
 		 898 aa  62.4  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80446  protein involved in Golgi retention and vacuolar sorting  41.77 
 
 		 684 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.914331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30347  predicted protein  41.76 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.192095 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24489  predicted protein  40.22 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3137  predicted protein  43.84 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06300  lipid binding protein, putative  38.27 
 
 		 493 aa  55.1  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153716  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03594  vacuolar protein sorting-associated protein Vps5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12830)  41.46 
 
 		 561 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108154  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03584  Sorting nexin-4 (Autophagy-related protein 24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B797]  39.77 
 
 		 487 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30264  putative golgi membrane protein-sorting protein  37.18 
 
 		 158 aa  51.2  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398749  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10594  sorting nexin Snx3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06880)  41.27 
 
 		 142 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93346  predicted protein  35.44 
 
 		 700 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54632  predicted protein  30 
 
 		 591 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.397245 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02650  hypothetical protein  30.91 
 
 		 144 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>