16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30264 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30264  putative golgi membrane protein-sorting protein  100 
 
 		 158 aa  326  6e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398749  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10594  sorting nexin Snx3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06880)  69.12 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02650  hypothetical protein  67.18 
 
 		 144 aa  193  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369261  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06300  lipid binding protein, putative  31.97 
 
 		 493 aa  75.5  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153716  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30347  predicted protein  35.43 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.192095 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24489  predicted protein  32.03 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  31.25 
 
 		 898 aa  60.5  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03584  Sorting nexin-4 (Autophagy-related protein 24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B797]  29.55 
 
 		 487 aa  57.4  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93346  predicted protein  37.35 
 
 		 700 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3137  predicted protein  32.23 
 
 		 392 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03550  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  37.18 
 
 		 612 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199341  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04551  Putative SNARE complex subunit Vam7 (Eurofung)  38.55 
 
 		 833 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0544426 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10918  sorting nexin Mvp1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17180)  42.03 
 
 		 738 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547553 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03594  vacuolar protein sorting-associated protein Vps5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12830)  31.34 
 
 		 561 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27578  predicted protein  30.93 
 
 		 505 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.57601  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54632  predicted protein  29.13 
 
 		 591 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.397245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>