21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04350 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND04350  protein transporter, putative  100 
 
 		 898 aa  1826    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03594  vacuolar protein sorting-associated protein Vps5, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12830)  39.84 
 
 		 561 aa  266  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80446  protein involved in Golgi retention and vacuolar sorting  27.36 
 
 		 684 aa  173  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.914331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_3137  predicted protein  26.92 
 
 		 392 aa  122  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30347  predicted protein  38.74 
 
 		 458 aa  93.6  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.192095 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03584  Sorting nexin-4 (Autophagy-related protein 24) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B797]  24.85 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06300  lipid binding protein, putative  34.75 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.153716  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27578  predicted protein  23.31 
 
 		 505 aa  75.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.57601  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24489  predicted protein  30.38 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10594  sorting nexin Snx3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06880)  32.67 
 
 		 142 aa  63.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03550  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  41.89 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199341  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30264  putative golgi membrane protein-sorting protein  31.25 
 
 		 158 aa  60.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.398749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93346  predicted protein  21.45 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274788  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04910  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  23.32 
 
 		 817 aa  55.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.9404  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02650  hypothetical protein  30.1 
 
 		 144 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.369261  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03560  hypothetical protein  25.71 
 
 		 638 aa  51.2  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54632  predicted protein  29.29 
 
 		 591 aa  48.9  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.397245 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45401  predicted protein  28.03 
 
 		 830 aa  48.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02560  signal transducer, putative  27.98 
 
 		 1151 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01377  intermediate filament, regulator of G-protein signaling (Eurofung)  29.47 
 
 		 1224 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10918  sorting nexin Mvp1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17180)  30.56 
 
 		 738 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.547553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>