34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_89680 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_89680  TRP-containing protein  100 
 
 
299 aa  598  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0997439  normal  0.462279 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23164  predicted protein  28.76 
 
 
489 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.137553  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 
207 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04060  expressed protein  30.83 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.388844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
376 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.31 
 
 
738 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
392 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.55 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
308 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1062  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
687 aa  46.2  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04583  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D (PPIase D)(Rotamase D)(EC 5.2.1.8) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4E7]  26.58 
 
 
372 aa  45.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0519322  normal  0.28877 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 
540 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26425  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type  26.72 
 
 
542 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00827135  normal  0.159204 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  28.8 
 
 
1154 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50233  predicted protein  25.83 
 
 
386 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0164202  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
356 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  26.81 
 
 
334 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
243 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
292 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  41.18 
 
 
791 aa  42.7  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 
286 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
269 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>