36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2181 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  167  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2583  hypothetical protein  92.59 
 
 
81 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  82.72 
 
 
81 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3919  hypothetical protein  82.72 
 
 
81 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  80.25 
 
 
81 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  79.01 
 
 
81 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  78.75 
 
 
80 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2545  hypothetical protein  66.67 
 
 
84 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0747  hypothetical protein  65.48 
 
 
84 aa  120  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0741  hypothetical protein  65.48 
 
 
84 aa  120  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2161  hypothetical protein  64.2 
 
 
84 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.726744  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7506  hypothetical protein  65 
 
 
85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2481  hypothetical protein  62.5 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2204  hypothetical protein  62.5 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  0.887365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1566  hypothetical protein  60.49 
 
 
81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1763  hypothetical protein  60.49 
 
 
81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.668208  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6759  hypothetical protein  62.5 
 
 
85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138276  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0587  hypothetical protein  63.75 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824652  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3232  hypothetical protein  59.26 
 
 
85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1118  hypothetical protein  59.26 
 
 
81 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2547  hypothetical protein  56.79 
 
 
81 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1111  hypothetical protein  56.79 
 
 
81 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0870  hypothetical protein  57.33 
 
 
82 aa  100  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0983  hypothetical protein  61.33 
 
 
84 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0184566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0924  hypothetical protein  58.11 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929821  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2605  hypothetical protein  56.94 
 
 
87 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0820871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0492  hypothetical protein  46.94 
 
 
64 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1505  hypothetical protein  35.94 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0487  hypothetical protein  46.94 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621147  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0566  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0474  hypothetical protein  47.92 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2476  hypothetical protein  38.6 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0546  hypothetical protein  44.9 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000158423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0255  hypothetical protein  40.35 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0317  hypothetical protein  36.84 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3295  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>