26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2204 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2204  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  185  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  0.887365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2481  hypothetical protein  98.86 
 
 		 88 aa  183  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2161  hypothetical protein  93.18 
 
 		 84 aa  169  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.726744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7506  hypothetical protein  82.5 
 
 		 85 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6759  hypothetical protein  80 
 
 		 85 aa  140  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138276  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0587  hypothetical protein  73.75 
 
 		 85 aa  130  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3232  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  65 
 
 		 81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  65 
 
 		 81 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  67.95 
 
 		 80 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  65 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3919  hypothetical protein  63.75 
 
 		 81 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2583  hypothetical protein  63.75 
 
 		 81 aa  116  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  62.5 
 
 		 81 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2545  hypothetical protein  60.47 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0741  hypothetical protein  60.47 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0747  hypothetical protein  60.47 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1118  hypothetical protein  58.75 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1566  hypothetical protein  58.44 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1763  hypothetical protein  58.44 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.668208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2605  hypothetical protein  60 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0870  hypothetical protein  54.55 
 
 		 82 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2547  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0983  hypothetical protein  55.68 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0184566 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1111  hypothetical protein  56.58 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0924  hypothetical protein  55.17 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929821  normal  0.30191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>