26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7506 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7506  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  180  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6759  hypothetical protein  96.47 
 
 
85 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138276  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2161  hypothetical protein  82.14 
 
 
84 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.726744  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2481  hypothetical protein  83.54 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2204  hypothetical protein  82.5 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  0.887365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0587  hypothetical protein  78.82 
 
 
85 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  66.25 
 
 
81 aa  120  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2583  hypothetical protein  67.5 
 
 
81 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3919  hypothetical protein  65.82 
 
 
81 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  65 
 
 
81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  65 
 
 
81 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  67.5 
 
 
80 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  65 
 
 
81 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3232  hypothetical protein  57.14 
 
 
85 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0747  hypothetical protein  58.33 
 
 
84 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0741  hypothetical protein  58.33 
 
 
84 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2545  hypothetical protein  58.33 
 
 
84 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1566  hypothetical protein  58.75 
 
 
81 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1763  hypothetical protein  58.75 
 
 
81 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.668208  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1118  hypothetical protein  60.53 
 
 
81 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0983  hypothetical protein  55.95 
 
 
84 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0184566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2547  hypothetical protein  53.75 
 
 
81 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1111  hypothetical protein  55 
 
 
81 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0870  hypothetical protein  53.95 
 
 
82 aa  97.4  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2605  hypothetical protein  57.69 
 
 
87 aa  97.1  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0820871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0924  hypothetical protein  55.84 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929821  normal  0.30191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>