26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2605 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  183  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820871 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2204  hypothetical protein  60 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  0.887365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2481  hypothetical protein  60 
 
 		 88 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2161  hypothetical protein  60.26 
 
 		 84 aa  103  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.726744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0587  hypothetical protein  58.97 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1118  hypothetical protein  60.53 
 
 		 81 aa  100  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0747  hypothetical protein  57.5 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0741  hypothetical protein  57.5 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2545  hypothetical protein  57.5 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3232  hypothetical protein  53.01 
 
 		 85 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1111  hypothetical protein  59.72 
 
 		 81 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  60.27 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7506  hypothetical protein  57.69 
 
 		 85 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6759  hypothetical protein  57.69 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138276  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  60.27 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  57.53 
 
 		 80 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3919  hypothetical protein  57.53 
 
 		 81 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0924  hypothetical protein  51.76 
 
 		 86 aa  93.2  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929821  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  58.9 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1763  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.668208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1566  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0983  hypothetical protein  53.95 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0184566 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2583  hypothetical protein  57.53 
 
 		 81 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  56.94 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2547  hypothetical protein  49.35 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0870  hypothetical protein  46.75 
 
 		 82 aa  84.7  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>