26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2161 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2161  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.726744  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2481  hypothetical protein  93.18 
 
 
88 aa  169  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2204  hypothetical protein  93.18 
 
 
88 aa  169  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  0.887365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7506  hypothetical protein  82.14 
 
 
85 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6759  hypothetical protein  79.76 
 
 
85 aa  143  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138276  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0587  hypothetical protein  73.81 
 
 
85 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824652  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  65.43 
 
 
81 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  65.43 
 
 
81 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  64.2 
 
 
81 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2583  hypothetical protein  65.43 
 
 
81 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3232  hypothetical protein  60.71 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3919  hypothetical protein  64.2 
 
 
81 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  67.5 
 
 
80 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  65.43 
 
 
81 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2545  hypothetical protein  60.71 
 
 
84 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0747  hypothetical protein  60.71 
 
 
84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0741  hypothetical protein  60.71 
 
 
84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1118  hypothetical protein  59.26 
 
 
81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1566  hypothetical protein  58.02 
 
 
81 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1763  hypothetical protein  58.02 
 
 
81 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.668208  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2547  hypothetical protein  54.32 
 
 
81 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2605  hypothetical protein  60.26 
 
 
87 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0820871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1111  hypothetical protein  55.56 
 
 
81 aa  103  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0870  hypothetical protein  54.55 
 
 
82 aa  103  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111601  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0983  hypothetical protein  55.95 
 
 
84 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0184566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0924  hypothetical protein  57.89 
 
 
86 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929821  normal  0.30191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>