26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0983 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0983  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  173  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0184566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0924  hypothetical protein  75.58 
 
 
86 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.929821  normal  0.30191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1118  hypothetical protein  56.96 
 
 
81 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0587  hypothetical protein  57.14 
 
 
85 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824652  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2161  hypothetical protein  55.95 
 
 
84 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.726744  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7506  hypothetical protein  55.95 
 
 
85 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  59.21 
 
 
81 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2204  hypothetical protein  55.68 
 
 
88 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  0.887365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2481  hypothetical protein  55.68 
 
 
88 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3919  hypothetical protein  55.7 
 
 
81 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  56.58 
 
 
81 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6759  hypothetical protein  53.57 
 
 
85 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138276  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  61.33 
 
 
81 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  59.21 
 
 
80 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2583  hypothetical protein  60 
 
 
81 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  56.58 
 
 
81 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2545  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.724379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1763  hypothetical protein  55.26 
 
 
81 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.668208  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1566  hypothetical protein  55.26 
 
 
81 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.130699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1111  hypothetical protein  52.38 
 
 
81 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3232  hypothetical protein  52.94 
 
 
85 aa  91.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2605  hypothetical protein  53.95 
 
 
87 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0820871 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0741  hypothetical protein  48.81 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0747  hypothetical protein  48.81 
 
 
84 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2547  hypothetical protein  53.95 
 
 
81 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0870  hypothetical protein  53.95 
 
 
82 aa  88.2  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.111601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>