64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0487 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0487  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  137  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0621147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0474  hypothetical protein  96.92 
 
 		 65 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0566  hypothetical protein  93.85 
 
 		 65 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0546  hypothetical protein  84.13 
 
 		 64 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000158423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0492  hypothetical protein  80.95 
 
 		 64 aa  116  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1819  hypothetical protein  69.49 
 
 		 62 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1534  hypothetical protein  67.8 
 
 		 62 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1061  hypothetical protein  58.46 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0292  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0587  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2420  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0829  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0833  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0033  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0659  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.619308  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0991  hypothetical protein  54.84 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0666  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0455  hypothetical protein  50.82 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.445992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2021  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2661  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.620222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2632  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0685  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.532051  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3281  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2679  hypothetical protein  50.82 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2552  hypothetical protein  50.82 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733693  normal  0.983543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0625  hypothetical protein  56.14 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000281892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5963  hypothetical protein  50.82 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.23421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3295  hypothetical protein  57.89 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0317  hypothetical protein  49.25 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0702  hypothetical protein  61.22 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00942627  hitchhiker  0.000000331825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0204  hypothetical protein  47.76 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0546  hypothetical protein  61.22 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.823502  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1208  hypothetical protein  51.56 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1302  hypothetical protein  39.71 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.121261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0535  hypothetical protein  50.88 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.303482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0183  hypothetical protein  51.67 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0265  hypothetical protein  49.25 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0202  hypothetical protein  47.76 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2135  hypothetical protein  50.94 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0148  hypothetical protein  48.48 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0507  hypothetical protein  50.79 
 
 		 67 aa  63.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2476  hypothetical protein  57.78 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0255  hypothetical protein  55.56 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0304  hypothetical protein  54.35 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02626  hypothetical protein  54.39 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0302  Zinc finger, CHCC-type  51.79 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.651805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3551  hypothetical protein  55.32 
 
 		 46 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.772899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3349  hypothetical protein  56.25 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2791  hypothetical protein  54 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0067  hypothetical protein  58.14 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0081  hypothetical protein  58.14 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0466  hypothetical protein  51.02 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2264  hypothetical protein  42.42 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2134  hypothetical protein  43.14 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2750  hypothetical protein  51.22 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2623  hypothetical protein  51.22 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1118  hypothetical protein  46.77 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0335  hypothetical protein  43.48 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1854  hypothetical protein  43.48 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3291  hypothetical protein  41.82 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.641744  hitchhiker  0.00862607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2132  hypothetical protein  42.59 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2181  hypothetical protein  46.94 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5236  hypothetical protein  42.59 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3148  hypothetical protein  43.86 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.03875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>