17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1742 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1742  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  922    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.199498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2170  tetratricopeptide TPR_2  83.15 
 
 		 446 aa  772    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425666  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2344  hypothetical protein  65.01 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95942  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2532  tetratricopeptide TPR_2  65.46 
 
 		 442 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3156  hypothetical protein  65.38 
 
 		 442 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 473 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2347  hypothetical protein  23.5 
 
 		 458 aa  107  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  25.2 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1557  hypothetical protein  27.98 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  3.4261e-20  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1676  hypothetical protein  35.09 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1898  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 458 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262238 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1324  hypothetical protein  24.35 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0130583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.72 
 
 		 1979 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1126  hypothetical protein  21.9 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 602 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0303  tetratricopeptide TPR_4  28.42 
 
 		 453 aa  43.5  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>