12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3156 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3156  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  899    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2344  hypothetical protein  88.06 
 
 		 444 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95942  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2532  tetratricopeptide TPR_2  76.96 
 
 		 442 aa  690    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2170  tetratricopeptide TPR_2  67.37 
 
 		 446 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1742  hypothetical protein  65.15 
 
 		 451 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.199498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 		 473 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2347  hypothetical protein  23.88 
 
 		 458 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  24.18 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1557  hypothetical protein  29.35 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  3.4261e-20  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1676  hypothetical protein  30.67 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1898  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262238 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1324  hypothetical protein  22.14 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0130583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>