10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0303 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0303  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 453 aa  902    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1898  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1126  hypothetical protein  25.43 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1382  hypothetical protein  26.98 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1059  hypothetical protein  34.35 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2677  hypothetical protein  36.62 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.297281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1940  hypothetical protein  22.74 
 
 		 517 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  31.72 
 
 		 431 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1742  hypothetical protein  28.42 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.199498 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 375 aa  43.1  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>