70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3957 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3957  CutC family protein  100 
 
 		 247 aa  481  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2098  CutC family protein  40.61 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0830016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0103  CutC family protein  35.5 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0537  CutC family protein  36.84 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6120  CutC family protein  36.9 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0445  CutC family protein  36.61 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8110  CutC family protein  31.74 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0141  CutC family protein  28.95 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4291  putative copper homeostasis protein CutC  31.17 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0416  CutC family protein  27.56 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.378773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2879  CutC family protein  25.45 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2065  CutC family protein  23.91 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0160506  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3123  putative copper homeostasis protein CutC  24.55 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3124  copper homeostasis protein CutC, putative  24.11 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00332926  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2813  copper homeostasis protein  24.11 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0344066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2852  copper homeostasis protein  24.11 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3091  putative copper homeostasis protein CutC  24.67 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.448462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3105  putative copper homeostasis protein CutC  24.11 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2145  putative copper homeostasis protein CutC  24.67 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6254  copper homeostasis protein  26.96 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0546193  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3100  copper homeostasis protein CutC  23.66 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0130724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2885  copper homeostasis protein CutC  23.66 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0253  CutC family protein  25.26 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2268  cutC family protein  29.24 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0408  cutC family protein  29.24 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0387  CutC family protein  29.24 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2018  cutC family protein  29.24 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3076  cutC family protein  29.24 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0104  cutC family protein  29.24 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0569  CutC family protein  29.24 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0331  CutC family protein  26.75 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2984  CutC family protein  31.9 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6287  CutC family protein  32.33 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2440  copper homeostasis protein CutC  25.12 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2143  CutC family protein  22.33 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.100517  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2243  CutC family protein  24.4 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000244128  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0615  CutC family protein  28.86 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0059352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0336  cutC family protein  29.02 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2068  CutC family protein  24.79 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0035151  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1312  copper homeostasis protein CutC  25.74 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.282361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0111  CutC family protein  33.85 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2957  CutC family protein  33.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0696  copper homeostasis protein  27.86 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3411  CutC family protein  24.6 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0379  CutC family protein  22.22 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728727  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2610  copper homeostasis protein CutC  24.38 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2847  CutC family protein  32.76 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01834  hypothetical protein  24.38 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1969  copper homeostasis protein CutC  24.38 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1758  copper homeostasis protein CutC  24.38 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.147041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2442  copper homeostasis protein CutC  22.02 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2106  copper homeostasis protein CutC  24.38 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1766  CutC family protein  24.38 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.570596  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5700  CutC family protein  25.87 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2121  copper homeostasis protein CutC  25.98 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000595386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2061  copper homeostasis protein CutC  25.98 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3976  CutC family protein  24.88 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.298928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6298  hypothetical protein  33.85 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.981767  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1340  copper homeostasis protein CutC  25.98 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249959  hitchhiker  0.00015365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1216  copper homeostasis protein CutC  25.98 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2086  copper homeostasis protein CutC  24.26 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34940  uncharacterized protein involved in copper resistance  39.02 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.350651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2167  copper homeostasis protein CutC  25.49 
 
 		 248 aa  45.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08940  uncharacterized protein involved in copper resistance  29.29 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3488  CutC family protein  26.21 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2935  CutC family protein  32.33 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2321  CutC  32.33 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1809  copper homeostasis protein CutC  24.88 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01038  hypothetical protein  25.35 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2183  CutC family protein  22.82 
 
 		 248 aa  42  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>