101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8110 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8110  CutC family protein  100 
 
 
232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0103  CutC family protein  45.37 
 
 
230 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0537  CutC family protein  46.29 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2098  CutC family protein  45.13 
 
 
224 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0830016  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6120  CutC family protein  47.16 
 
 
226 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0445  CutC family protein  44 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4291  putative copper homeostasis protein CutC  37.18 
 
 
232 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0416  CutC family protein  34.96 
 
 
231 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.378773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2984  CutC family protein  35.44 
 
 
241 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0104  cutC family protein  37.33 
 
 
237 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0569  CutC family protein  37.33 
 
 
237 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3076  cutC family protein  37.33 
 
 
237 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.857236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2018  cutC family protein  37.33 
 
 
237 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0387  CutC family protein  37.33 
 
 
237 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0408  cutC family protein  37.33 
 
 
237 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2268  cutC family protein  37.33 
 
 
237 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2879  CutC family protein  30.43 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0141  CutC family protein  37.29 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618466  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0336  cutC family protein  37.34 
 
 
294 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2065  CutC family protein  30.87 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0160506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1634  CutC family protein  26.11 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000333988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2145  putative copper homeostasis protein CutC  29.87 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3124  copper homeostasis protein CutC, putative  29.87 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00332926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3123  putative copper homeostasis protein CutC  29.87 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3091  putative copper homeostasis protein CutC  29.44 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.448462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0331  CutC family protein  33.33 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2813  copper homeostasis protein  29.44 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0344066  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3105  putative copper homeostasis protein CutC  29.44 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2852  copper homeostasis protein  29.44 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2440  copper homeostasis protein CutC  30.41 
 
 
247 aa  91.7  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2268  copper homeostasis protein CutC  29.41 
 
 
254 aa  91.7  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2847  CutC family protein  35.44 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1809  copper homeostasis protein CutC  27.98 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2957  CutC family protein  35.44 
 
 
241 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5700  CutC family protein  34.98 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3957  CutC family protein  31.42 
 
 
247 aa  89.7  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6287  CutC family protein  35.02 
 
 
241 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2885  copper homeostasis protein CutC  29 
 
 
225 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3100  copper homeostasis protein CutC  29 
 
 
225 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0130724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2171  copper homeostasis protein CutC  29.86 
 
 
254 aa  88.6  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.728264  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0477  copper homeostasis protein CutC, putative  25.33 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.149399  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2321  CutC  35.02 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.123479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2935  CutC family protein  35.02 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6254  copper homeostasis protein  34.09 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0546193  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0615  CutC family protein  34.85 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0059352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2086  copper homeostasis protein CutC  26.82 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34940  uncharacterized protein involved in copper resistance  38.65 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.350651  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0696  copper homeostasis protein  34.17 
 
 
268 aa  82  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0253  CutC family protein  24.89 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2243  CutC family protein  29.27 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000244128  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0360  CutC family protein  35.44 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703439  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3976  CutC family protein  31.66 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal  0.298928 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2068  CutC family protein  27.62 
 
 
241 aa  80.9  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0035151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6298  hypothetical protein  35.29 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.981767  normal  0.120697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1312  copper homeostasis protein CutC  29.95 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.282361 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2610  copper homeostasis protein CutC  29.82 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1766  CutC family protein  29.82 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.570596  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1969  copper homeostasis protein CutC  29.82 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2106  copper homeostasis protein CutC  29.82 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1758  copper homeostasis protein CutC  29.82 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.147041  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01834  hypothetical protein  29.82 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01619  copper homeostasis protein  34.92 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.894385  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2167  copper homeostasis protein CutC  29.82 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0714  copper homeostasis protein CutC  28.5 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0376007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2788  copper homeostasis protein CutC  27.92 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3488  CutC family protein  33.51 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2153  copper homeostasis protein CutC  27.86 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2040  copper homeostasis protein CutC  27.86 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2431  copper homeostasis protein CutC  27.86 
 
 
254 aa  72  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0488343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2425  CutC  33.8 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.424028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2143  CutC family protein  32.65 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.100517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2061  copper homeostasis protein CutC  28.02 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0153  CutC family protein  32.73 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6564  CutC family protein  30.15 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.397235  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2442  copper homeostasis protein CutC  27.62 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3411  CutC family protein  35.14 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4050  CutC family protein  34.93 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1216  copper homeostasis protein CutC  26.83 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1340  copper homeostasis protein CutC  26.83 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.249959  hitchhiker  0.00015365 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1768  CutC family protein  32.6 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2121  copper homeostasis protein CutC  27.54 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000595386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01038  hypothetical protein  27.47 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0147  CutC family protein  31.05 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2183  CutC family protein  25.85 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167358  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00017  copper homeostasis protein CutC, putative (JCVI)  31.27 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4782  CutC family protein  33.18 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.853064  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004375  cytoplasmic copper homeostasis protein CutC  27.89 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0263  copper homeostasis protein  26.83 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0379  CutC family protein  24 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0127  CutC  31.28 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.585644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4340  CutC family protein  35.29 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1517  copper homeostasis protein  26.88 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0248  copper homeostasis protein CutC, putative  26.18 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1702  CutC family protein  28.78 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0301  CutC  32.51 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0254  CutC family protein  25.26 
 
 
207 aa  52.4  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0111  CutC family protein  30.88 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2066  copper homeostasis protein CutC  27.54 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000325056 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2276  hypothetical protein  31.69 
 
 
208 aa  48.5  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08940  uncharacterized protein involved in copper resistance  32.18 
 
 
265 aa  47  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>