More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2604 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2604  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
405 aa  823    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.119684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30280  acyl-CoA dehydrogenase  69.98 
 
 
402 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.689981  normal  0.352098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66040  putative acyl-CoA dehydrogenase  70.32 
 
 
402 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5729  putative acyl-CoA dehydrogenase  70.57 
 
 
402 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0599  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.55 
 
 
403 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0199  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  68.38 
 
 
406 aa  543  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3463  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.34 
 
 
407 aa  541  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4456  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.43 
 
 
403 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13161  acyl-CoA dehydrogenase fadE23  64.2 
 
 
401 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1603  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  66.01 
 
 
404 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.936409  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1627  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.01 
 
 
404 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1573  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.01 
 
 
404 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  62.29 
 
 
411 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1906  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.12 
 
 
408 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4826  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  61.73 
 
 
397 aa  504  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3102  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  56.4 
 
 
397 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000235524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.5 
 
 
399 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0145058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0958  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.99 
 
 
423 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1888  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.47 
 
 
418 aa  309  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.421707  hitchhiker  0.00545764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2971  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.23 
 
 
418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0144  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.89 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0736  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.9 
 
 
404 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.17 
 
 
380 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0788  butyryl-CoA dehydrogenase  35.31 
 
 
380 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.54 
 
 
379 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  38.17 
 
 
379 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  38.49 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  39.22 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  37.85 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  36.95 
 
 
379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  38.49 
 
 
379 aa  201  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  38.49 
 
 
379 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.17 
 
 
379 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  38.17 
 
 
379 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  38.17 
 
 
379 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  38.17 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  38.23 
 
 
379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.72 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  37.85 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.92 
 
 
379 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.75 
 
 
376 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0305  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.16 
 
 
404 aa  189  5e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1659  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.66 
 
 
390 aa  190  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  31.42 
 
 
379 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  31.42 
 
 
379 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2216  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.07 
 
 
375 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3522  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.07 
 
 
375 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0559083 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.35 
 
 
383 aa  187  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0142  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.94 
 
 
404 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0485827  decreased coverage  0.00000521293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2867  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.83 
 
 
375 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.967944  normal  0.115681 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.23 
 
 
379 aa  186  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1134  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.46 
 
 
404 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.24 
 
 
379 aa  186  9e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4269  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.11 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0207447  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  37.26 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.38 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.129524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1586  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.83 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4625  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.25 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.252732  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0762  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.42 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  0.783766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1842  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 
375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0292697  normal  0.208883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1431  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.9 
 
 
409 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.180118  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.29 
 
 
641 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
381 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.15 
 
 
385 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
376 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.7 
 
 
404 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
376 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33 
 
 
380 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4391  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.58 
 
 
386 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  33.84 
 
 
381 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
381 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  32.81 
 
 
381 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.69 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.13 
 
 
382 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  32.73 
 
 
375 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3106  acyl-CoA dehydrogenase-like  33.94 
 
 
375 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6504  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.99 
 
 
375 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.285028  normal  0.547313 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.81 
 
 
376 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1379  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.98 
 
 
409 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  35.31 
 
 
383 aa  179  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.12 
 
 
379 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2567  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 
403 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.4 
 
 
381 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.81 
 
 
381 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4384  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.47 
 
 
375 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17615  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.18 
 
 
403 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.463039  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  34.95 
 
 
380 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3829  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.99 
 
 
403 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0298  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.91 
 
 
381 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  33.54 
 
 
379 aa  177  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2500  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.8 
 
 
386 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0453809  normal  0.399884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2684  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.47 
 
 
375 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.126402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.54 
 
 
380 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0447  acyl-CoA dehydrogenase  32.47 
 
 
375 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  36.57 
 
 
389 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31540  putative acyl-CoA dehydrogenase  32.47 
 
 
375 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.430124  hitchhiker  0.000095284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>