More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1167 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1167  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.63 
 
 
287 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.76 
 
 
271 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.81 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  29.59 
 
 
294 aa  129  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.72 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20900  aerobic-type carbon monoxide dehydrogenase, middle subunit CoxM/CutM-like protein  34.18 
 
 
294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.15 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  32.86 
 
 
490 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  29.92 
 
 
280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.04 
 
 
305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.83 
 
 
450 aa  113  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  31.69 
 
 
294 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  34.77 
 
 
514 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.78 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137285  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0643  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.86 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.56 
 
 
488 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.66 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.66 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.79 
 
 
295 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.53 
 
 
288 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.8 
 
 
287 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  27.66 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.66 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  27.66 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.66 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.66 
 
 
292 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1489  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  33.21 
 
 
280 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.88 
 
 
285 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.53 
 
 
492 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1747  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  30.39 
 
 
287 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.795465  normal  0.613894 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.44 
 
 
295 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2764  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.76 
 
 
291 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000220689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  27.3 
 
 
292 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.43 
 
 
288 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.32 
 
 
468 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.8 
 
 
488 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4200  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  31.14 
 
 
277 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.690695 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30 
 
 
284 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.97 
 
 
286 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.96 
 
 
289 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.93 
 
 
292 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.75 
 
 
461 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.04 
 
 
507 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  31.03 
 
 
291 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0841  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.98 
 
 
288 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  hitchhiker  0.00000381307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0552  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.38 
 
 
288 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  30.56 
 
 
289 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5357  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.73 
 
 
285 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2184  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.78 
 
 
273 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1956  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.24 
 
 
295 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0844554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.67 
 
 
512 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  31.77 
 
 
543 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.79 
 
 
481 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  28.08 
 
 
288 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5284  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  32.09 
 
 
290 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.08 
 
 
288 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.59 
 
 
286 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.72 
 
 
285 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2230  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.56 
 
 
291 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.68 
 
 
273 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.75 
 
 
487 aa  99.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  31.85 
 
 
496 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4236  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.68 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.64 
 
 
289 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0342  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.93 
 
 
288 aa  99  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.461873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  27.8 
 
 
283 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.33 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.939597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  26.24 
 
 
499 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2002  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  30.6 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3595  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.37 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232061  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1291  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.33 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.18 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1562  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  26.62 
 
 
289 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.915322 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.93 
 
 
492 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2176  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.72 
 
 
275 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1380  Carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  26.76 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.860557  normal  0.37299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  27.34 
 
 
480 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.19 
 
 
292 aa  96.3  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  30.29 
 
 
492 aa  95.9  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  27.18 
 
 
494 aa  95.5  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  28.98 
 
 
504 aa  95.5  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.02 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.47 
 
 
496 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.89 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3561  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.8 
 
 
292 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1638  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  29.7 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.921721  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  29.79 
 
 
496 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2587  molybdopterin dehydrogenase  32.63 
 
 
287 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.551287  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.37 
 
 
512 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2020  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.79 
 
 
292 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1751  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.54 
 
 
267 aa  92  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179717  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  32 
 
 
493 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.97 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0222  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.12 
 
 
292 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.67 
 
 
467 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3677  carbon monoxide dehydrogenase medium subunit  28.01 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4414  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.76 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.18 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1871  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  27.93 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00397526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>