16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2744 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2744  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  165  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0843  hypothetical protein  55.26 
 
 
84 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1683  hypothetical protein  38.16 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2097  hypothetical protein  35.06 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2427  hypothetical protein  38.24 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0383  hypothetical protein  34.67 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.495785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0157  hypothetical protein  31.71 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3461  hypothetical protein  31.71 
 
 
83 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0618  hypothetical protein  34.67 
 
 
75 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0169113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2035  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000212527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0219  hypothetical protein  29.63 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0573  hypothetical protein  35.82 
 
 
82 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000287244  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0946  hypothetical protein  37.14 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1471  hypothetical protein  30 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000207529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0482  hypothetical protein  30 
 
 
72 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0788  hypothetical protein  30.99 
 
 
86 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>