14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0788 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0788  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  179  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0989  hypothetical protein  43.06 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000272768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0383  hypothetical protein  53.42 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2427  hypothetical protein  40.54 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0157  hypothetical protein  39.73 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0946  hypothetical protein  49.23 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3461  hypothetical protein  38.36 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2035  hypothetical protein  35.62 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000212527  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1471  hypothetical protein  33.8 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000207529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3871  YcfA family protein  46.97 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.651851 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0618  hypothetical protein  40.58 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0169113  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0482  hypothetical protein  30.43 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0798  YcfA family protein  35.9 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2744  hypothetical protein  30.99 
 
 		 80 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>