15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0618 on replicon NC_009795
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009795  CCC13826_0618  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  149  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0169113  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0383  hypothetical protein  56 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2035  hypothetical protein  45.33 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000212527  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1471  hypothetical protein  40.79 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000207529  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0946  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2427  hypothetical protein  42.11 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0798  YcfA family protein  39.73 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2744  hypothetical protein  34.67 
 
 
80 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3871  YcfA family protein  42.19 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.651851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0157  hypothetical protein  37.33 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0788  hypothetical protein  40.58 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0843  hypothetical protein  31.34 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3461  hypothetical protein  36 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0482  hypothetical protein  28.99 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3321  hypothetical protein  39.47 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115184  normal  0.218351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>