15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0383 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0383  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0618  hypothetical protein  56 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0169113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0946  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2035  hypothetical protein  46.67 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000212527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0788  hypothetical protein  53.42 
 
 
86 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1471  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000207529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2427  hypothetical protein  37.97 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2744  hypothetical protein  34.67 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3871  YcfA family protein  41.54 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.651851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0843  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0798  YcfA family protein  38.36 
 
 
83 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0989  hypothetical protein  37.14 
 
 
78 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000272768  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0157  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0482  hypothetical protein  30.56 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3461  hypothetical protein  32 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>