12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0843 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0843  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  173  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2744  hypothetical protein  55.26 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1683  hypothetical protein  32.89 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2097  hypothetical protein  27.78 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0383  hypothetical protein  35.53 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2035  hypothetical protein  31.51 
 
 
75 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000212527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0219  hypothetical protein  33.33 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.58964  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0946  hypothetical protein  38.36 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0618  hypothetical protein  31.34 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0169113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3461  hypothetical protein  27.5 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0157  hypothetical protein  27.5 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2427  hypothetical protein  27.85 
 
 
83 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>