14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0946 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0946  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0383  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  96.7  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0618  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0169113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2035  hypothetical protein  41.33 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000212527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2427  hypothetical protein  44 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0788  hypothetical protein  45.83 
 
 
86 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0989  hypothetical protein  40.85 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000272768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1471  hypothetical protein  41.33 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000207529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0798  YcfA family protein  43.06 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2744  hypothetical protein  37.14 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0843  hypothetical protein  38.36 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0482  hypothetical protein  37.14 
 
 
72 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0157  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3461  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>