13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3871 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3871  YcfA family protein  100 
 
 
81 aa  164  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.651851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0157  hypothetical protein  53.95 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3461  hypothetical protein  52.63 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2427  hypothetical protein  46.75 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0618  hypothetical protein  44 
 
 
75 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0169113  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0383  hypothetical protein  40.26 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.495785  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0989  hypothetical protein  42.11 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000272768  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0788  hypothetical protein  44.74 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2744  hypothetical protein  38.16 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2035  hypothetical protein  37.66 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000212527  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1471  hypothetical protein  33.77 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000207529  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0798  YcfA family protein  36 
 
 
83 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0482  hypothetical protein  34.33 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>