15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2427 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2427  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  173  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3461  hypothetical protein  55.42 
 
 		 83 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0157  hypothetical protein  54.22 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0788  hypothetical protein  40.54 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0946  hypothetical protein  47.62 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0618  hypothetical protein  42.11 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0169113  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0383  hypothetical protein  37.97 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.495785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3871  YcfA family protein  47.69 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.651851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2744  hypothetical protein  38.24 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0798  YcfA family protein  34.57 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0989  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000272768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1471  hypothetical protein  33.82 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.0000000000207529  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1683  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.676398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0843  hypothetical protein  27.85 
 
 		 84 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2035  hypothetical protein  30.38 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000212527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>