33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0390 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  100 
 
 		 151 aa  300  3.0000000000000004e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  39.04 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  38.36 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  34.67 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  40.58 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  33.78 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  31.33 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  36.99 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  33.1 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  37.06 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  40.71 
 
 		 148 aa  84.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  36.62 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  37.96 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  30.07 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  34.27 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  33.33 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  35.04 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  30.77 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  35.51 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  34.48 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  32.41 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  32.86 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  32.12 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  31.72 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  31.72 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  32.41 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  34.93 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  34.93 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  34.9 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  35.62 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  32.41 
 
 		 190 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  32.09 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  31.03 
 
 		 194 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>