33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01090 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  100 
 
 
194 aa  384  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  67.22 
 
 
192 aa  215  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  64.21 
 
 
190 aa  214  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  64.13 
 
 
189 aa  189  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  62.01 
 
 
192 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  40.41 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  38.06 
 
 
150 aa  105  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  39.16 
 
 
149 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  39.55 
 
 
148 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  38.81 
 
 
150 aa  101  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  37.76 
 
 
149 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  38.89 
 
 
150 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  38.81 
 
 
150 aa  99  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  35.66 
 
 
149 aa  99  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  40.44 
 
 
152 aa  98.2  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  40.97 
 
 
153 aa  96.7  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  40.6 
 
 
155 aa  96.3  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  37.31 
 
 
150 aa  95.1  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  40.54 
 
 
148 aa  94.7  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  36.57 
 
 
149 aa  91.7  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  36.57 
 
 
149 aa  91.7  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  36.57 
 
 
149 aa  90.1  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  35.82 
 
 
149 aa  89.4  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  34.23 
 
 
148 aa  88.2  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  35.82 
 
 
148 aa  87.4  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  34.9 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  36.5 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  38.81 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  34.84 
 
 
147 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  33.79 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  30.87 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  31.54 
 
 
147 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  40.91 
 
 
158 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>