33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2236 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  100 
 
 		 149 aa  296  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  89.93 
 
 		 149 aa  273  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  66.44 
 
 		 149 aa  208  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  61.74 
 
 		 148 aa  188  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  60.14 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  55.1 
 
 		 150 aa  168  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  54.55 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  50.35 
 
 		 148 aa  156  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  55.56 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  54.23 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  54.35 
 
 		 150 aa  153  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  53.62 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  55.24 
 
 		 148 aa  143  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  45.14 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  45.14 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  45.14 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  43.06 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  44.83 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  45.52 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  43.06 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  43.75 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  43.97 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  44.14 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  44.14 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  39.04 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  42.65 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  39.58 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  40.14 
 
 		 189 aa  86.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  43.38 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  37.76 
 
 		 192 aa  83.6  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  37.76 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  36.81 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  41.18 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>