33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0550 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  100 
 
 		 150 aa  299  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  70.67 
 
 		 150 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  72 
 
 		 150 aa  221  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  66.22 
 
 		 150 aa  205  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  65.97 
 
 		 148 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  57.75 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  52.38 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  55.07 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  53.19 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  56.25 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  54.35 
 
 		 149 aa  153  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  53.47 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  51.43 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  51.43 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  51.06 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  50 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  48.65 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  52.21 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  46.04 
 
 		 148 aa  128  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  42.34 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  43.88 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  40.85 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  41.55 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  42.07 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  41.96 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  38.73 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  39.74 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  34.67 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  39.84 
 
 		 192 aa  91.3  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  39.85 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  37.31 
 
 		 192 aa  87.4  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  38.81 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  39.1 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>