33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86681 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  70.59 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  64.13 
 
 		 194 aa  205  4e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  58.2 
 
 		 192 aa  194  5.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  60.67 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  41.79 
 
 		 150 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  41.55 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  41.43 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  38.62 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  41.48 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  37.25 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  35.92 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  40.14 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  40.14 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  36.55 
 
 		 150 aa  98.6  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  41.89 
 
 		 148 aa  98.6  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  37.59 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  38.17 
 
 		 149 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  38.17 
 
 		 149 aa  95.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  38.17 
 
 		 149 aa  95.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  37.59 
 
 		 148 aa  93.6  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  38.17 
 
 		 149 aa  93.6  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  38.46 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  34.51 
 
 		 148 aa  89.4  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  33.33 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  34.53 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  34.93 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  34.07 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  36.3 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  31.75 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  30.22 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  33.33 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  34.07 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>