33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0228 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  89.93 
 
 
149 aa  273  5e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  65.77 
 
 
149 aa  206  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  64.43 
 
 
148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  60.81 
 
 
153 aa  179  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  56.46 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  54.55 
 
 
148 aa  166  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  52.45 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  55.07 
 
 
150 aa  156  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  54.23 
 
 
150 aa  154  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  53.47 
 
 
152 aa  148  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  52.17 
 
 
150 aa  144  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  53.15 
 
 
148 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  45.14 
 
 
148 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  45.14 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  43.75 
 
 
149 aa  124  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  43.75 
 
 
149 aa  124  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  43.06 
 
 
155 aa  124  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  42.36 
 
 
149 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  42.55 
 
 
150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  42.07 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  41.38 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  40.69 
 
 
147 aa  107  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  41.38 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  41.55 
 
 
190 aa  99  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  41.91 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  38.36 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  39.16 
 
 
192 aa  87  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  40.14 
 
 
189 aa  86.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  44.12 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  38.46 
 
 
192 aa  83.6  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  39.16 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  38.97 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>