33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1710 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1710  50S ribosomal protein L19e  100 
 
 		 152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0155799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0092  50S ribosomal protein L19e  55.26 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000444774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2236  Ribosomal protein L19e  55.56 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0550  50S ribosomal protein L19e  53.47 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.437569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0582  50S ribosomal protein L19e  54.48 
 
 		 150 aa  152  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0522753  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1846  Ribosomal protein L19e  52.74 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0460  50S ribosomal protein L19e  51.72 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2431  50S ribosomal protein L19e  50.68 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0228  Ribosomal protein L19e  53.47 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.129864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2235  50S ribosomal protein L19e  52.41 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000217277  normal  0.577583 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0099  50S ribosomal protein L19e  52.41 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.991542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0019  50S ribosomal protein L19e  54.17 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000168936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2310  50S ribosomal protein L19e  46.26 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.348153  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0662  50S ribosomal protein L19e  50 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00691512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1256  50S ribosomal protein L19e  50 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.021288  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0728  50S ribosomal protein L19e  50 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.76769  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0161  50S ribosomal protein L19e  49.33 
 
 		 149 aa  133  9e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00000681634  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1503  Ribosomal protein L19e  48.67 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108897  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1402  50S ribosomal protein L19e  46.98 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.754312  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0238  50S ribosomal protein L19e  42.95 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1867  50S ribosomal protein L19e  44.14 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2007  50S ribosomal protein L19e  40.69 
 
 		 147 aa  107  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0174  50S ribosomal protein L19e  42.07 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1255  50S ribosomal protein L19e  40.69 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.563803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0109  50S ribosomal protein L19e  40.52 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000123544  unclonable  0.000000342934 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30262  predicted protein  42.54 
 
 		 192 aa  90.1  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.535143  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1760  Ribosomal protein L19e  39.72 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0011  50S ribosomal protein L19e  43.15 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0579006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86681  predicted protein  41.48 
 
 		 189 aa  83.6  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.696448  normal  0.779358 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0390  50S ribosomal protein L19e  36.62 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189985 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10740  60S ribosomal protein L19 (AFU_orthologue; AFUA_2G07970)  39.26 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119482  ribosomal protein L19  38.97 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0528113  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01090  60S ribosomal protein L19, putative  40.44 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>