More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_R0070 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_R0069  23S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 3125 bp  1742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0079  23S ribosomal RNA  90.18 
 
 		 3125 bp  1754    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0061  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 3123 bp  1168    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0030  23S ribosomal RNA  89.99 
 
 		 3124 bp  1735    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0063  23S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 3078 bp  1294    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0012  23S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 3079 bp  1294    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0026  23S ribosomal RNA  90.26 
 
 		 3108 bp  1235    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0909246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0020  23S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 3104 bp  1080    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.44622 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0038  23S ribosomal RNA  88.83 
 
 		 3119 bp  1287    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0315307  normal  0.0121247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10560  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 3113 bp  1249    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491594  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0045  23S ribosomal RNA  88.27 
 
 		 3088 bp  1380    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000567155  hitchhiker  0.00126487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0067  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 3132 bp  1540    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459802  decreased coverage  0.00789268 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0043  23S ribosomal RNA  83.05 
 
 		 2993 bp  753    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0048  23S ribosomal RNA  88.34 
 
 		 3088 bp  1388    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000200922  hitchhiker  0.000167099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0030  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3125 bp  1663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00123294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0014  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3125 bp  1663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0044  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3119 bp  1534    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000156713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0064  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 3123 bp  1168    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12350  23S ribosomal RNA  88.52 
 
 		 3086 bp  1051    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.102229  normal  0.0554684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13560  23S ribosomal RNA  90.34 
 
 		 3074 bp  1239    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0214535  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0028  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 3123 bp  1168    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000019415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0018  23S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 3125 bp  1742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0024  23S ribosomal RNA  87.18 
 
 		 3027 bp  912    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0078  23S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 3104 bp  1080    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0062  23S ribosomal RNA  89.49 
 
 		 3147 bp  1441    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14280  23S ribosomal RNA  88.44 
 
 		 3093 bp  1096    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0043021  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0022  23S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 2993 bp  745    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.851566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25520  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 3130 bp  1271    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05570  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 3130 bp  1271    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0059  23S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 3078 bp  1294    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0028  23S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 3131 bp  1445    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.286035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0016  23S ribosomal RNA  90.26 
 
 		 3108 bp  1235    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0031  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3119 bp  1534    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61901  decreased coverage  0.0000132248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0055  23S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 3125 bp  1742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0180695  normal  0.232411 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0069  23S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 3104 bp  1080    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0803597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0043  23S ribosomal RNA  89.25 
 
 		 3131 bp  1445    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0035  23S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 3125 bp  1742    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0051  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3125 bp  1663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21640  23S ribosomal RNA  90.34 
 
 		 3074 bp  1239    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0019  23S ribosomal RNA  88.83 
 
 		 3120 bp  1285    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236447  normal  0.130623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0021  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 3123 bp  1168    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37130  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 3113 bp  1239    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.756619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0006  23S ribosomal RNA  89.7 
 
 		 3121 bp  1183    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0313545  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04510  23S ribosomal RNA  90.34 
 
 		 3074 bp  1239    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.705654  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0033  23S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 3104 bp  1080    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.597756  normal  0.430938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0016  23S ribosomal RNA  87.66 
 
 		 3124 bp  1168    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06920  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 3113 bp  1249    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03870  23S ribosomal RNA  88.73 
 
 		 3093 bp  1120    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.322045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0056  23S ribosomal RNA  88.47 
 
 		 3104 bp  1080    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.260476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0052  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 3132 bp  1540    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450843  decreased coverage  0.00133177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0024  23S ribosomal RNA  92.4 
 
 		 3102 bp  2014    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.105103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0043  23S ribosomal RNA  92.47 
 
 		 3102 bp  2022    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.595466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0048  23S ribosomal RNA  92.47 
 
 		 3102 bp  2022    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0066  23S ribosomal RNA  92.47 
 
 		 3102 bp  2022    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0043  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 3139 bp  1419    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0032  23S ribosomal RNA  88.35 
 
 		 3143 bp  1275    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0496031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0041  23S ribosomal RNA  88.35 
 
 		 3143 bp  1275    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.924188 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0077  23S ribosomal RNA  99.58 
 
 		 3094 bp  5987    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.366535  normal  0.0405336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07390  23S ribosomal RNA  88.42 
 
 		 3086 bp  1043    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.170063  normal  0.154032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07450  23S ribosomal RNA  89.92 
 
 		 3130 bp  1271    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0034  23S ribosomal RNA  88.1 
 
 		 3132 bp  1540    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351192  normal  0.0184688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0040  23S ribosomal RNA  89.39 
 
 		 3078 bp  1294    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22210  23S ribosomal RNA  88.25 
 
 		 3113 bp  1249    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790169  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0006  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3119 bp  1534    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.13304  normal  0.0554387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0046  23S ribosomal RNA  89.47 
 
 		 3125 bp  1663    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0442831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0029  23S ribosomal RNA  89.38 
 
 		 3109 bp  1461    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655069  decreased coverage  0.000196644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0023  23S ribosomal RNA  89.38 
 
 		 3109 bp  1461    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0016  23S ribosomal RNA  89.38 
 
 		 3109 bp  1461    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0039  23S ribosomal RNA  87.73 
 
 		 3105 bp  1469    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522575  normal  0.211989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0047  23S ribosomal RNA  87.73 
 
 		 3105 bp  1469    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.137502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0023  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 3146 bp  1136    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338933  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0040  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 3163 bp  1136    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.806858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0017  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 3138 bp  1170    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421867  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0022  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 3138 bp  1170    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0030  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 3138 bp  1170    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0063  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 3138 bp  1170    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0066  23S ribosomal RNA  87.57 
 
 		 3138 bp  1170    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0035  23S ribosomal RNA  87.29 
 
 		 3116 bp  1310    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.192227 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1406  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 3046 bp  779    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000288708 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1411  23S ribosomal RNA  84.92 
 
 		 3046 bp  779    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0005  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 3139 bp  1419    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0031  23S ribosomal RNA  88.46 
 
 		 3139 bp  1419    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.683425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0033  23S ribosomal RNA  88.59 
 
 		 3128 bp  1126    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.17604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0042  23S ribosomal RNA  88.59 
 
 		 3128 bp  1126    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0020  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 3146 bp  1136    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.975491  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0037  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 3163 bp  1136    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12038  normal  0.0152335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0026  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 3154 bp  1136    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0041  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 3154 bp  1136    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0929172  normal  0.0265153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0020  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 3147 bp  1136    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.268646  normal  0.128175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0037  23S ribosomal RNA  89.4 
 
 		 3140 bp  1136    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0260428  decreased coverage  0.00255969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0024  23S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 3160 bp  1112    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462275  normal  0.147023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0039  23S ribosomal RNA  89.1 
 
 		 3159 bp  1112    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190986  normal  0.175722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0006  23S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 3108 bp  1542    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.244636  normal  0.640558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0032  23S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 3108 bp  1542    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.042272  normal  0.364879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0042  23S ribosomal RNA  89.54 
 
 		 3108 bp  1542    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.448799  decreased coverage  0.00833876 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0049  23S ribosomal RNA  89.7 
 
 		 3121 bp  1183    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.835565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0028  23S ribosomal RNA  89.7 
 
 		 3122 bp  1183    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14047  23S ribosomal RNA  86.51 
 
 		 3138 bp  1063    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000193754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0035  23S ribosomal RNA  89.49 
 
 		 3147 bp  1441    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0052  23S ribosomal RNA  89.49 
 
 		 3147 bp  1441    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>