69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3108 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3108  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2789  hypothetical protein  54.44 
 
 
205 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1049  hypothetical protein  54.59 
 
 
202 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1346  GCN5-related N-acetyltransferase  54.64 
 
 
182 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  hitchhiker  0.00238745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  53.72 
 
 
189 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00228907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
195 aa  121  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1406  GCN5-related N-acetyltransferase  39.11 
 
 
187 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  39.56 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.227906  normal  0.330934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27890  acetyltransferase  38.29 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
189 aa  104  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0219466  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2658  GCN5-related N-acetyltransferase  40.31 
 
 
200 aa  104  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2977  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
198 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163391  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5121  GCN5-related N-acetyltransferase  39.11 
 
 
203 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000669532  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  40.11 
 
 
189 aa  101  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0890687  normal  0.064624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3534  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0518327  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1395  GCN5-related N-acetyltransferase  42.75 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22834  hitchhiker  0.000414904 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  36.32 
 
 
223 aa  88.2  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2246  acetyltransferase  33.57 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00633338  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3278  hypothetical protein  33.51 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3329  hypothetical protein  33.51 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3267  hypothetical protein  33.51 
 
 
197 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2955  acetyltransferase  34.04 
 
 
174 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2410  acetyltransferase  33.57 
 
 
237 aa  85.5  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.938573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2427  acetyltransferase, GNAT family  32.86 
 
 
174 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.539619 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2509  acetyltransferase, GNAT family  32.14 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
174 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.017504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2166  acetyltransferase  32.14 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2445  acetyltransferase  32.14 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12198  hypothetical protein  33 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2179  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4392  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1774  acetyltransferase  37.5 
 
 
159 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.62 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  41.1 
 
 
119 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0667  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45 
 
 
152 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000569259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2567  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.63 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.203985  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2663  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.63 
 
 
159 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.51966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.64 
 
 
184 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.58 
 
 
147 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  37.63 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5127  hypothetical protein  31.79 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229715  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  50 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.06 
 
 
160 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00106333  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
316 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.773188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1293  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.48 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.489062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  32.97 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.97 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.97 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.97 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.97 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.97 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.97 
 
 
148 aa  42.7  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
178 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.23018 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4811  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
98 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345894  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4966  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
98 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013936  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4914  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
98 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0583375  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3731  GCN5-related N-acetyltransferase  23.23 
 
 
172 aa  42.4  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.25 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4879  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
98 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00181448  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4972  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
98 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
178 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.079466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.16 
 
 
147 aa  42  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3896  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
184 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12561  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.16 
 
 
147 aa  41.6  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01144  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  40.35 
 
 
164 aa  41.6  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0271075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1776  acetyltransferase  31.15 
 
 
136 aa  41.2  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>