45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1406 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1406  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27890  acetyltransferase  61.5 
 
 
188 aa  233  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3534  GCN5-related N-acetyltransferase  53.57 
 
 
196 aa  195  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0518327  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2977  GCN5-related N-acetyltransferase  51.53 
 
 
198 aa  194  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163391  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3278  hypothetical protein  52.04 
 
 
197 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3329  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3267  hypothetical protein  51.02 
 
 
197 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  53.01 
 
 
196 aa  185  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.227906  normal  0.330934 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12198  hypothetical protein  49.5 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2658  GCN5-related N-acetyltransferase  52.33 
 
 
200 aa  181  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  49.03 
 
 
223 aa  164  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  49.17 
 
 
189 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0219466  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  46.41 
 
 
189 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0890687  normal  0.064624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  41.8 
 
 
195 aa  137  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5121  GCN5-related N-acetyltransferase  43.72 
 
 
203 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000669532  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2789  hypothetical protein  38.42 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
189 aa  124  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00228907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1346  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
182 aa  121  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  hitchhiker  0.00238745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3108  GCN5-related N-acetyltransferase  39.11 
 
 
204 aa  118  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1395  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
259 aa  106  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22834  hitchhiker  0.000414904 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1049  hypothetical protein  36.21 
 
 
202 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
174 aa  94  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.017504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2955  acetyltransferase  31.39 
 
 
174 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840233 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2427  acetyltransferase, GNAT family  27.53 
 
 
174 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.539619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2445  acetyltransferase  30.15 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2509  acetyltransferase, GNAT family  27.53 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2246  acetyltransferase  30.15 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00633338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2410  acetyltransferase  26.37 
 
 
237 aa  86.3  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.938573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2166  acetyltransferase  28.68 
 
 
143 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2179  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  40.24 
 
 
322 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2002  putative acetyltransferase  42.65 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06411  GNAT family N-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00870)  34.57 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355701  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1356  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0397036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2609  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
491 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2083  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0325128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3229  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2464  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2520  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.18 
 
 
165 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710408  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
154 aa  42  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.48 
 
 
149 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
141 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.336219  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
151 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
181 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>