42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1395 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1395  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
259 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22834  hitchhiker  0.000414904 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5121  GCN5-related N-acetyltransferase  78.84 
 
 
203 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000669532  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  43.3 
 
 
189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0219466  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  42.05 
 
 
189 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0890687  normal  0.064624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1406  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
187 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2789  hypothetical protein  38.54 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1346  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
182 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  hitchhiker  0.00238745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  40.78 
 
 
189 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00228907  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27890  acetyltransferase  40.11 
 
 
188 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1049  hypothetical protein  35.18 
 
 
202 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
196 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.227906  normal  0.330934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3108  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
204 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2246  acetyltransferase  29.38 
 
 
174 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00633338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2410  acetyltransferase  29.38 
 
 
237 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.938573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2427  acetyltransferase, GNAT family  27.84 
 
 
174 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.539619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2445  acetyltransferase  32.12 
 
 
174 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0100394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  37.02 
 
 
195 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
174 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.017504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2509  acetyltransferase, GNAT family  27.84 
 
 
174 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2166  acetyltransferase  30.66 
 
 
143 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2955  acetyltransferase  31.85 
 
 
174 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3534  GCN5-related N-acetyltransferase  31.12 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0518327  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2977  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
198 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163391  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3278  hypothetical protein  30.61 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12198  hypothetical protein  31.28 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2179  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3267  hypothetical protein  30.1 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3329  hypothetical protein  30.1 
 
 
197 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2658  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
143 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
156 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6442  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
151 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5576  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
151 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
145 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
145 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3483  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
181 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5940  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
151 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.465162 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  37.74 
 
 
157 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
145 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>