47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27890  acetyltransferase  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1406  GCN5-related N-acetyltransferase  61.5 
 
 		 187 aa  233  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3534  GCN5-related N-acetyltransferase  54.4 
 
 		 196 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0518327  normal  0.60816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  55.38 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.227906  normal  0.330934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2977  GCN5-related N-acetyltransferase  53.57 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163391  normal  0.745902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3267  hypothetical protein  51.81 
 
 		 197 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3329  hypothetical protein  51.81 
 
 		 197 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3278  hypothetical protein  51.81 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.658459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12198  hypothetical protein  50.5 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2658  GCN5-related N-acetyltransferase  46.23 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3029  GCN5-related N-acetyltransferase  48.54 
 
 		 223 aa  158  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  49.17 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0219466  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  48.35 
 
 		 189 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0890687  normal  0.064624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  45.79 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2789  hypothetical protein  42.86 
 
 		 205 aa  141  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1346  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.685722  hitchhiker  0.00238745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  42.13 
 
 		 189 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00228907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5121  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000669532  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3108  GCN5-related N-acetyltransferase  38.29 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1049  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.017504  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2955  acetyltransferase  34.06 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1395  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 		 259 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22834  hitchhiker  0.000414904 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2410  acetyltransferase  28.33 
 
 		 237 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.938573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2427  acetyltransferase, GNAT family  28.81 
 
 		 174 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.539619 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2509  acetyltransferase, GNAT family  28.81 
 
 		 174 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2246  acetyltransferase  28.81 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00633338  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2166  acetyltransferase  32.35 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2445  acetyltransferase  30.88 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2179  GCN5-related N-acetyltransferase  42.74 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0304  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 		 143 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0312411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.86 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  43.06 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4392  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.7 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4775  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40 
 
 		 150 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 		 167 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3942  acetyltransferase, GNAT family  28.1 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000096173  decreased coverage  0.00543726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1401  acetyltransferase, GNAT family  28.1 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000159569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3829  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760698 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.92 
 
 		 148 aa  42.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432705  normal  0.0282239 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0380  acetyltransferase  30.77 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.335252  hitchhiker  0.000000351254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.78 
 
 		 150 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3709  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.09 
 
 		 213 aa  41.2  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000200619  unclonable  0.000000018593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3483  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>