205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1774 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_1774  acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  329  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.619579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1522  GCN5-related N-acetyltransferase  43.22 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3659  GCN5-related N-acetyltransferase  38.84 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2291  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101571  normal  0.149434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1720  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.547473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1775  acetyltransferase  28.93 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.393861  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.73 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0689  acetyltransferase  33.72 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00474298  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.78 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.31 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.17 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0942  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
191 aa  50.4  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1970  GCN5-related N-acetyltransferase  40.3 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3108  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
204 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.803314  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4874  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0667  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.38 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000569259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.31 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.31 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.37 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.89 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.89 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.89 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.89 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  38.89 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6162  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
176 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6455  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
176 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51389  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
169 aa  47.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.358356  normal  0.62215 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.89 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.89 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.89 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2074  GCN5-related N-acetyltransferase  24.11 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4966  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.44 
 
 
98 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4972  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.44 
 
 
98 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4811  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.44 
 
 
98 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345894  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4914  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.44 
 
 
98 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0583375  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31320  acetyltransferase  40.74 
 
 
160 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128466  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1584  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.806577 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4879  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.44 
 
 
98 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00181448  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3070  acetyltransferase, GNAT family  23.18 
 
 
151 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.82 
 
 
162 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4109  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.923761  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2789  hypothetical protein  34.74 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2721  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
154 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4213  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.43 
 
 
148 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
149 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
150 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.75 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1461  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1544  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.405729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1821  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.477403  normal  0.159791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6596  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
286 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214759  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.18 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13681  predicted protein  41.07 
 
 
323 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.66 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4793  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17430  acetyltransferase  33.73 
 
 
317 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00870  hypothetical protein  38.71 
 
 
243 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1928  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6597  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2071  acetyltransferase, GNAT family  28.21 
 
 
289 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
315 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.17 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2602  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229806  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0801  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.05 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
150 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
304 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3713  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
204 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0651  acetyltransferase  26.32 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  24.29 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1365  putative acetyltransferase  44.23 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
287 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  24.29 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5497  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000151492  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1342  acetyltransferase  29.73 
 
 
264 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0732306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  27.34 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14911  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.21 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.11 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
337 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.427678  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  26.27 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  24.14 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  29.49 
 
 
295 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1216  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
301 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.514639  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2571  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
316 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  24.29 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>