31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0202 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  54 
 
 
156 aa  157  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  44.85 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  40.31 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  39.72 
 
 
145 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  37.59 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  39.06 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2840  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  40.91 
 
 
180 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09170  hypothetical protein  34.65 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18490  hypothetical protein  33.76 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  34.97 
 
 
181 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2109  hypothetical protein  28.68 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3208  hypothetical protein  33.83 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1596  hypothetical protein  47.95 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0390754  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5987  hypothetical protein  30.69 
 
 
180 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11170  hypothetical protein  33.91 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0582043  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2513  secreted protein  38.3 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1273  hypothetical protein  31.25 
 
 
229 aa  50.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170661  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1163  hypothetical protein  32.14 
 
 
224 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.000000032705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2309  hypothetical protein  35.33 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000375151  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2250  secreted protein  38.1 
 
 
167 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000517374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4218  hypothetical protein  32.19 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19108  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  34.38 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1976  hypothetical protein  29.2 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524667  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1910  hypothetical protein  29.2 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  26.81 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08800  hypothetical protein  37.04 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125431  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1930  hypothetical protein  29.2 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.900616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1679  hypothetical protein  29.7 
 
 
157 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0785238  hitchhiker  0.00456336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10780  hypothetical protein  34.51 
 
 
166 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.727919  normal  0.390752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>