25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3445 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  282  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  51.05 
 
 
156 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  44.85 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  46.56 
 
 
145 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  45.52 
 
 
145 aa  105  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  36.19 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  38.32 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  33.78 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5987  hypothetical protein  35.79 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2109  hypothetical protein  34.11 
 
 
204 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  33.06 
 
 
174 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  33.62 
 
 
180 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2250  secreted protein  36.57 
 
 
167 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000517374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1679  hypothetical protein  32.76 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0785238  hitchhiker  0.00456336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11170  hypothetical protein  34.86 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0582043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1163  hypothetical protein  28.12 
 
 
224 aa  45.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.000000032705 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10780  hypothetical protein  37.18 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.727919  normal  0.390752 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18490  hypothetical protein  35.42 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08800  hypothetical protein  34.52 
 
 
150 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125431  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  33.08 
 
 
181 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2840  hypothetical protein  31.43 
 
 
192 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09170  hypothetical protein  31.73 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1273  hypothetical protein  28.83 
 
 
229 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170661  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3610  hypothetical protein  32.37 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2149  hypothetical protein  29.49 
 
 
207 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>