18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3290 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  342  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  39.07 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  33.55 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  36.73 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  36.36 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  31.51 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  37.4 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  31.3 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  30.82 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1273  hypothetical protein  30.97 
 
 		 229 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.727919  normal  0.390752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2513  secreted protein  32.23 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2109  hypothetical protein  45.76 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2250  secreted protein  30.58 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000517374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11170  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0582043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1163  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000032705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3610  hypothetical protein  34.75 
 
 		 204 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08800  hypothetical protein  31.5 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>