17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2109 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2109  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1273  hypothetical protein  34.88 
 
 
229 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170661  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1163  hypothetical protein  35.68 
 
 
224 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.000000032705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  35.09 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  34.11 
 
 
141 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  33.77 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  28.68 
 
 
155 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  34.17 
 
 
168 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09170  hypothetical protein  29.94 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5987  hypothetical protein  36.08 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  45.76 
 
 
174 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  36.67 
 
 
180 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2309  hypothetical protein  34.09 
 
 
155 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000375151  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2149  hypothetical protein  29.75 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  30 
 
 
181 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4218  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>