17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_09170  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  357  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5987  hypothetical protein  57.63 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12995  hypothetical protein  39.01 
 
 
181 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00625198  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4218  hypothetical protein  37.25 
 
 
200 aa  92  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19108  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2149  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1976  hypothetical protein  39.73 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524667  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1910  hypothetical protein  39.73 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1930  hypothetical protein  39.73 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.900616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  38.73 
 
 
191 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2840  hypothetical protein  37.23 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  41.13 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3208  hypothetical protein  32.78 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  36.43 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  34.52 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  30.77 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  29.13 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2109  hypothetical protein  31.07 
 
 
204 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>