14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2309 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2309  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  299  9e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000375151  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1679  hypothetical protein  42.04 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0785238  hitchhiker  0.00456336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1596  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0390754  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11170  hypothetical protein  48.39 
 
 
158 aa  103  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0582043  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2250  secreted protein  45.39 
 
 
167 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000517374 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18490  hypothetical protein  44.44 
 
 
165 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2284  hypothetical protein  47.74 
 
 
152 aa  97.1  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0855432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2513  secreted protein  43.07 
 
 
167 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197512  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08800  hypothetical protein  47.83 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1365  secreted protein  43.55 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866634  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10780  hypothetical protein  40.83 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.727919  normal  0.390752 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  35.33 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  34.85 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  37.61 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>