19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1596 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1596  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  317  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0390754  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2309  hypothetical protein  49.38 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000375151  hitchhiker  0.00239676 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2250  secreted protein  39.88 
 
 
167 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000517374 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18490  hypothetical protein  43.2 
 
 
165 aa  104  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2513  secreted protein  39.86 
 
 
167 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11170  hypothetical protein  45.74 
 
 
158 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0582043  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10780  hypothetical protein  40.71 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.727919  normal  0.390752 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08800  hypothetical protein  39.37 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.125431  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1679  hypothetical protein  33.56 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0785238  hitchhiker  0.00456336 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2284  hypothetical protein  40.65 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0855432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1365  secreted protein  40.48 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866634  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  34.11 
 
 
155 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  35.04 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  25.76 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  32.35 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  31.86 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  28.46 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  40 
 
 
191 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>