194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1085 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1085  bacitracin resistance protein BacA  100 
 
 
153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.286814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1629  bacitracin resistance protein BacA  71.43 
 
 
256 aa  184  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2081  bacitracin resistance protein BacA  32.04 
 
 
265 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4952  undecaprenol kinase  33.33 
 
 
269 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181278  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04545  putative undecaprenol kinase  24.31 
 
 
264 aa  54.7  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  37.25 
 
 
273 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2242  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.91 
 
 
269 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.78 
 
 
278 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0172  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.36 
 
 
269 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.89 
 
 
283 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  34.13 
 
 
279 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0480  Bacitracin resistance protein BacA  34.17 
 
 
269 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.66 
 
 
287 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0605  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.03 
 
 
278 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0034  bacitracin resistance protein BacA  31.5 
 
 
237 aa  51.6  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.530544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0034  bacitracin resistance protein BacA  30.71 
 
 
237 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000586999  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1894  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.64 
 
 
267 aa  50.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.774072  normal  0.0647312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.07 
 
 
278 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  29.29 
 
 
274 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1174  bacitracin resistance protein BacA  30.57 
 
 
273 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  30.7 
 
 
262 aa  50.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0646  bacitracin resistance protein  31.3 
 
 
263 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000570462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  30.53 
 
 
281 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.25 
 
 
282 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0196  Bacitracin resistance protein BacA  28.57 
 
 
269 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  28.03 
 
 
258 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4274  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.08 
 
 
267 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  28.32 
 
 
285 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  28.7 
 
 
278 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  30.08 
 
 
274 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0394  bacitracin resistance protein BacA  38.96 
 
 
249 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.41 
 
 
282 aa  47.8  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2634  Undecaprenyl-diphosphatase  29.14 
 
 
269 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0466  bacitracin resistance protein BacA  32.26 
 
 
249 aa  47.8  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.13617  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  30.17 
 
 
289 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0441  bacitracin resistance protein BacA  34.51 
 
 
249 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4294  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.89 
 
 
274 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000020273  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1525  bacitracin resistance protein BacA  33.63 
 
 
249 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00563996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3568  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  23.66 
 
 
272 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.96 
 
 
273 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.23 
 
 
277 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  27.43 
 
 
280 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1660  Bacitracin resistance protein BacA  29.29 
 
 
267 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.96 
 
 
270 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.96 
 
 
273 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.96 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  22.96 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2625  Bacitracin resistance protein BacA  28.45 
 
 
278 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113574  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  22.96 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  30.71 
 
 
272 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7544  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.81 
 
 
341 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.166412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0858  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.09 
 
 
278 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.2 
 
 
266 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2561  undecaprenol kinase  29.89 
 
 
252 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000943331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.96 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.91 
 
 
278 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  21.48 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.96 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4622  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.96 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  28.57 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0594  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0640  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.19 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0192783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0810  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3409  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  22.9 
 
 
272 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0714  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.38134  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.91 
 
 
278 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.41 
 
 
293 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0738  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6963000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0559  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.19 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000591232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0297  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.19 
 
 
272 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00789183  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  32.65 
 
 
279 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0649  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0683  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.81 
 
 
270 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2096  undecaprenyl-diphosphatase  33.33 
 
 
270 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.76838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3674  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.03 
 
 
274 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.67 
 
 
261 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000720891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.11 
 
 
286 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0572  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.15 
 
 
270 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0302  bacitracin resistance protein BacA  31.4 
 
 
248 aa  44.7  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.425765  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.91 
 
 
294 aa  44.7  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.65 
 
 
266 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3201  undecaprenol kinase  47.06 
 
 
296 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2586  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.85 
 
 
259 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0713308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.65 
 
 
266 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.52 
 
 
266 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2769  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.85 
 
 
259 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.36 
 
 
276 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.65 
 
 
266 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1011  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.67 
 
 
291 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00382837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.65 
 
 
266 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.85 
 
 
259 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.12 
 
 
277 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2717  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.85 
 
 
259 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000013117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.73 
 
 
278 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2479  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.85 
 
 
259 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000149761  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.48 
 
 
266 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.93 
 
 
266 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>