More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3201 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3201  undecaprenol kinase  100 
 
 
296 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2789  undecaprenol kinase  87.59 
 
 
295 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  69.34 
 
 
291 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0282  Undecaprenyl-diphosphatase  65.26 
 
 
291 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  65.37 
 
 
290 aa  352  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  60.5 
 
 
290 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  47.39 
 
 
320 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  46.76 
 
 
322 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  46.76 
 
 
322 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.37 
 
 
288 aa  221  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.4 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.7 
 
 
283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.11 
 
 
312 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.76 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.66 
 
 
293 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  45.59 
 
 
272 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.45 
 
 
282 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
269 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  41.76 
 
 
272 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  44.12 
 
 
273 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  38.91 
 
 
274 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.34 
 
 
292 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
266 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09201  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
279 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0131837 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  37.46 
 
 
302 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0252  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0294819  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  39.1 
 
 
386 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.78 
 
 
282 aa  165  9e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.35 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  39.53 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.5 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.84 
 
 
265 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.45 
 
 
286 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.41 
 
 
283 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.5 
 
 
286 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  35.79 
 
 
291 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  39.37 
 
 
277 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.82 
 
 
266 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  37.68 
 
 
278 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.65 
 
 
265 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.15 
 
 
266 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.64 
 
 
278 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.31 
 
 
282 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10391  bacitracin resistance protein BacA  32.96 
 
 
266 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.160543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  36.96 
 
 
266 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.97 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  39.7 
 
 
285 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  37.36 
 
 
269 aa  155  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  36.82 
 
 
270 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  34.86 
 
 
279 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.82 
 
 
265 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.36 
 
 
266 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.38 
 
 
280 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.04 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.88 
 
 
264 aa  152  5e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.06 
 
 
267 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.84 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.86 
 
 
277 aa  152  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  35.32 
 
 
267 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.55 
 
 
276 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 
267 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  41.22 
 
 
281 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  37.92 
 
 
271 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  34.83 
 
 
289 aa  150  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  37.55 
 
 
271 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.38 
 
 
272 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.56 
 
 
276 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  40.54 
 
 
269 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  38.78 
 
 
274 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.07 
 
 
267 aa  148  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  37.23 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  37.16 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  37.32 
 
 
290 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.82 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.27 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.67 
 
 
266 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.02 
 
 
266 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.05 
 
 
266 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  35.55 
 
 
273 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  37.88 
 
 
267 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.57 
 
 
265 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09021  bacitracin resistance protein BacA  31.48 
 
 
266 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.4 
 
 
266 aa  143  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.88 
 
 
276 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09041  bacitracin resistance protein BacA  33.82 
 
 
274 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.64 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.26 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
267 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  34.88 
 
 
300 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.26 
 
 
266 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.84 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  36.65 
 
 
280 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0843  undecaprenyl-diphosphatase  32.96 
 
 
268 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.822614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>