58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2111 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2111  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  643    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2373  hypothetical protein  34.19 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117138  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6527  hypothetical protein  38.82 
 
 		 217 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.581879  normal  0.051531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1814  protein of unknown function DUF937  33.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.147031 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1866  hypothetical protein  33.68 
 
 		 140 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0031  hypothetical protein  33.68 
 
 		 140 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.48544  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1137  hypothetical protein  33.68 
 
 		 140 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6724  protein of unknown function DUF937  39.29 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1376  hypothetical protein  33.68 
 
 		 140 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2206  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5147  hypothetical protein  30.69 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.670787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1870  hypothetical protein  30.21 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.951704  hitchhiker  0.000304239 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6233  hypothetical protein  30.21 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1846  hypothetical protein  30.21 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1756  hypothetical protein  30.53 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1784  hypothetical protein  30.53 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1900  hypothetical protein  35.53 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0939  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933018  normal  0.683834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1427  hypothetical protein  29.47 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874769  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5279  protein of unknown function DUF937  34.83 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3775  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0871445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0434  hypothetical protein  35.14 
 
 		 183 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2528  hypothetical protein  32.73 
 
 		 131 aa  53.1  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0545  hypothetical protein  31.03 
 
 		 186 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2216  hypothetical protein  28.41 
 
 		 163 aa  52.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0562  hypothetical protein  28.05 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0601987  normal  0.0329184 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0441  hypothetical protein  35.14 
 
 		 154 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3664  protein of unknown function DUF937  27.72 
 
 		 133 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0283759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0738  hypothetical protein  34.62 
 
 		 150 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7138  protein of unknown function DUF937  27.78 
 
 		 143 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00491269  normal  0.388289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2744  hypothetical protein  35.62 
 
 		 135 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000751209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7942  protein of unknown function DUF937  29.63 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0267  hypothetical protein  28.05 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0305  protein of unknown function DUF937  30.86 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0112  hypothetical protein  31.25 
 
 		 134 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00850654  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0181  protein of unknown function DUF937  33.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.751703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1214  hypothetical protein  30.86 
 
 		 157 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.561487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3060  hypothetical protein  37.04 
 
 		 129 aa  46.2  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1884  hypothetical protein  31.46 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3772  protein of unknown function DUF937  24.75 
 
 		 133 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2092  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2429  hypothetical protein  32.61 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.585189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2923  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 590 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4053  hypothetical protein  32.93 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.233795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4423  protein of unknown function DUF937  32.93 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4535  protein of unknown function DUF937  32.93 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4063  hypothetical protein  29.76 
 
 		 132 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0478  protein of unknown function DUF937  28.05 
 
 		 186 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2683  protein of unknown function DUF937  30.11 
 
 		 116 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.237032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1730  protein of unknown function DUF937  28.57 
 
 		 210 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2353  hypothetical protein  31.4 
 
 		 145 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1992  protein of unknown function DUF937  27.27 
 
 		 146 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2062  hypothetical protein  26.25 
 
 		 192 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2222  hypothetical protein  34.74 
 
 		 140 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2388  hypothetical protein  34.74 
 
 		 140 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2260  hypothetical protein  34.74 
 
 		 140 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786219  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  30.21 
 
 		 584 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1319  hypothetical protein  34.72 
 
 		 194 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>