33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0917 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0917  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  100 
 
 		 79 aa  155  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.06 
 
 		 74 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0517  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.71 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.735802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1499  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  51.11 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.707569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0931  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.28 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3289  hydrogenase assembly chaperone HypC  43.55 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2887  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.55 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.348602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0503  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.76 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0508  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.76 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0475  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.76 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3015  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.97 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1538  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  50 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241221  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4098  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.33 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.94 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.26 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1024  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.73 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.169012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.48 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1737  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.9 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.175485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0366  hypothetical protein  43.18 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  38.67 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44.26 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1411  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.51 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0248831  normal  0.151516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1614  hypothetical protein  40.35 
 
 		 99 aa  43.9  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0101786  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  41.38 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1664  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.92 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.473831  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  45.65 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2331  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.88 
 
 		 94 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.64 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0388  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.984781  hitchhiker  0.00000000422403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  34.78 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01190  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  45.65 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.1 
 
 		 92 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>